红外吸收光谱（infraredabsorptionspectroscopy,IR)，又称为分子振动-转动光谱。当样品受到频率连续变化的红外光照射时，分子吸收了某个频率的辐射，并由其振动或转动运动引起偶极矩的净变化，产生分子振动或转动能级从基态到激发态的跃迁，使相应于这些吸收区域的透射光强度减弱。记录红外光的百分透射比与波长或波数关系的曲线，就得到红外吸收光谱。

已有人报道了细菌的红外光谱研究结果，他们基于对各种功能团的报告值，确定了微生物细胞中键的分布[22]。以3410cm-1为中心的宽带为一NH和一OH的伸缩振动吸收峰；在2958cm-1的峰为一CH3反对称伸缩振动吸收峰；在2876cm-1峰为一CH2的对称伸缩振动吸收峰；在2928cm-1的峰为一CH2反对称伸缩振动吸收峰；在2853cm-1的峰为一CH2的对称伸缩振动吸收峰；在1655cm-1的强峰是-C==0的伸缩振动酰胺工峰；在1535cm-1的峰为一O==C-NH-弯曲振动酰胺Ⅱ峰；在1456cm-1的峰为一CH2剪式振动吸收和一CH3反对称弯曲振动吸收重叠峰。

对苦味诺卡菌、草分枝杆菌、沟戈登菌、胶质芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌和水洗工业废菌进行的红外光谱分析结果如图所示。

由苦味诺卡菌红外光谱图可以看出，3410cm-1的宽带为多糖中一OH和氨基-NH2的振动吸收峰；1391cm-1为一COOH中一OH的面内弯曲振动吸收峰；1650cm-1处谱带对应乙酰胺基CH3一O=C-NH一中的一CO一的伸缩振动；1536cm-1是一O==C一NH一的弯曲振动吸收峰；在2958cm-1、2927cm-1、2872cm-1、2850cm-1、1450cm-1处出现的特征峰分别为细胞表面长烃链中一CH2和一CH2的不同振动；1234cm-1处是多糖中的一OH振动吸收峰；1073cm-1处是糖环中的一C一O一的振动吸收峰。

比较苦味诺卡菌与草分枝杆菌红外光谱图可以看出，草分枝杆菌的红外谱图中的（-NH2）在3423cm-1，将多糖中一OH宽峰覆盖；其他谱带位置仅有微小变化，在1168cm-1处的一C一OH波峰较明显。

由沟戈登菌红外光谱图可以看出，3448.39cm-1为中心的宽带为一NH和一OH的伸缩振动吸收峰；在2971.43、2921.66cm-1、1457.6cm-1的峰为烃基的不同形式的吸收峰；在1644.24cm-1的强峰的是酰胺基RCONH2的伸缩振动酰胺工峰；在1544.7cm-1的附近为酰胺Ⅱ带一NH的弯曲振动和C一N的伸缩振动峰；1407cm-1既有糖醛酸中一COOH的C一O伸缩振动，也有蛋白质酰胺Ⅲ带C一N一C的伸缩振动；1324.88cm-1的峰可能为硝基的弯曲振动吸收峰；1237.79cm-1处可能为酰胺Ⅳ带C一N的伸缩振动峰，可能还有P==O伸缩振动；1076.54cm-1的峰是糖环中的一C一O伸缩振动吸收峰和S==O的伸缩振动峰；545.16cm-1的峰可能是硫代磷酞基P=S的伸缩振动吸收峰，还有P一O一(C)的伸缩振动吸收峰。

由胶质芽孢杆菌红外光谱图可以看出，胶质芽孢杆菌在整个波谱范围内均有明显吸收，3440.09cm-1为中心的宽带为一NH和一OH的伸缩振动吸峰;2967.28cm-1、2925.81cm-1、的峰为一CH3、一CH2的伸缩振动吸收峰；在1457.6cm-1的峰为一CH2剪式振动吸收和一CH3反对称弯曲振动吸收重叠峰；在1648.39cm-1的强峰是酸胺基RCONH2的伸缩振动酰胺Ⅰ峰；在1544.70cm-1的峰是酰胺基RCONH2的伸缩振动酰胺Ⅱ峰；1399.54cm-1既有糖醛酸中一COOH的C一O伸缩振动，也有蛋白质酰胺Ⅳ带C一N一C伸缩振动；1316.59cm-1的峰可能为硝基的弯曲振动吸收峰；1233.64cm-1处可能为酸胺Ⅲ带C一N的伸缩振动峰，可能还有P==O伸缩振动；1080.18cm-1的峰是糖环中的一C一O伸缩振动吸收峰和S==O的伸缩振动峰；532.72cm-1的峰可能是硫代磷酞基P==S的伸缩振动吸收峰，还有P一O一（C）的伸缩振动吸收峰。

由枯草芽孢杆菌红外光谱图可以看出，3440.09cm-1为中心的宽带为一NH2和一OH的伸缩振动吸收峰；在2963.13cm-1、2925.81cm-1和1457.6cm-1的峰可能为一CH3、一CH2不同振动吸收峰；在1648.39cm-1的强峰是一O==C一NH一中C==0的伸缩振动峰；在1544.70cm-1的峰是酰胺基RCONH2的伸缩振动酰胺Ⅱ峰或为硝基的弯曲振动吸收峰；1403.69cm-1为一COOH中一OH的面内弯曲振动或一COO一伸缩振动吸收峰；1233.64cm-1处可能是一CH3中的一CH的面内弯曲振动或脂肪酸中C一O的伸缩振动；1071.89cm-1的峰是糖环中的一C一O一伸缩振动吸收峰；545.67cm-1的峰可能是硫代磷酞基P==S的伸缩振动吸收峰，还有P一O(C)的伸缩振动吸收峰。

由图还可以看出，苦味诺卡菌、草分枝杆菌、沟戈登菌、胶质芽孢杆菌4种微生物的峰位相似，说明它们的有机基团的组成相似，它们是NH2、C==O、N一H、一CH3、一OH、C一0及一NO2、P=S、P=O等，由特征峰和所含基团也可看出，微生物含有糖和蛋白质成分。

由水洗工业废菌红外光谱图可以看出，3419.35cm-1为中心的宽带为N一H和一OH的伸缩振动吸收峰，此处峰较宽；2963.13cm-1、2929.95cm-1、1457.6cm-1处的峰分别为长烃链中一CH3、一CH2伸缩振动吸收峰和一CH2剪式振动吸收和一CH2对称弯曲振动吸收重叠峰；在1652.53cm-1附近的吸收峰为酰胺I带伸缩振动峰；在1528.llcm-1附近为酰胺Ⅱ带N一H的弯曲振动和C一N的伸缩振动峰；1403.69cm-1为附近既有糖醛酸中一COOH的C一O伸缩振动，也有蛋白质酰胺Ⅳ带C一N一C伸缩振动；1241.94cm-1处可能为酞胺Ⅲ带C一N的伸缩振动峰，可能还有P==O伸缩振动；1047cm-1处为糖羟基中的C一O伸缩振动和S=O的伸缩振动峰；549.51cm-1的峰可能是硫代磷酰基P==S的伸缩振动吸收峰，还有P一O一(C)的伸缩振动吸收峰。