（一）作为保护对象和作为污染因素的生物

生物作为环境监测的对象时，可以有双重身份，它可以是环境保护的对象，即人体健康和生态系统中生物多样性及生物完整性的保护；同时，它也可以是环境管理控制的污染及外来干扰因素。

生物作为保护对象时，环境生物监测就是要搞清环境中生物对各种环境胁迫的响应是怎样的，这是环境生物监测的核心内容。

生物作为污染或干扰因素时，环境生物监测就是要搞清它们的强度和环境负面影响，

主要有以下几种类型：

(1)对病原体及其指示生物的监测，属原生性生物污染监测；

(2）对外来生物的监测，属原生性生物污染监测；

(3）对富营养化生物（藻类等）的监测，属次生性生物污染监测。

（二）环境胁迫与生物响应

环境胁迫的生物响应是环境生物监测的核心内容，因此，研究环境生物监测必须搞清环境胁迫和生物响应两个方面的有关内容。

胁迫是指引起生态系统发生变化、产生反应或功能失调的外力、外因或外部刺激。胁迫可分为正向胁迫（eustress）和逆向胁迫（dysstress )，正向胁迫并不影响生态系统的生存力（viability）和可持续力（suatainability )。这种胁迫重复发生，已经成为自然过程的组成部分，许多生态系统依此而维持。如草原上的火烧、潮间带的海浪冲刷等。然而在更为一般的意义上，胁迫通常指给生态系统造成负面效应（退化和转化）的逆向胁迫，主要涉及到以下几种：

(1)水生生物等可更新资源的开采（直接影响生态系统中的生物量）；

(2）污染物排放（发生在人类生产生活活动中），如污水、PCB、杀虫剂、重金属、石油及放射性等污染物质的排放，包括点源污染、面源污染等，是环境生物监测重点关注的胁迫因素；

(3)人为的物理重建（有目的地改变土地利用类型），如森林→农田、低地→城市、山谷→人工湖、湿地挤占、河道裁弯取直、水利设施建设等等；

(4)外来物种的引入、病原体的污染等生物胁迫因素；

(5）偶然发生的自然或社会事件，如洪水、地震、火山喷发、战争等。

环境胁迫在生命系统组建的各个层次（包括酶一基因等生物大分子、细胞器、细胞、组织、器官、个体、种群、群落、生态系统、景观等微观到宏观的）上都会有相应的响应。其响应的敏感性随着生命系统组建层次从宏观到微观不断增强，响应的速度不断加快（即时间不断减小），而生态关联性在减少。因此，作为短期预警及应急监测敏感指标的开发和筛选可在个体水平以下进行，作为中长期生态预警指标则更适合在种群以上水平筛选。物种是生命存在的基本形式，从兼顾生态关联性及响应敏感性来看，传统生物毒性检测主要定位在种群水平、生物监视主要定位在群落水平上是必需的，这是环境生物监测的基础。

（三）水环境生物监测的内容

按实际工作情况，水环境生物监测的内容主要包括以下4个方面：

（1)水生生物群落监测，主要包括大型底栖无脊椎动物、浮游植物、浮游动物、着生生物、鱼类、高等水生维管束植物，甚至微生物群落的监测；

(2)生态毒理及环境毒理监测，前者以水生生物为受试生物，后者以大小鼠及家兔等哺乳动物为受试生物；

(3）微生物卫生学监测；

(4）生物残毒及生物标志物监测。

水环境生物监测是以生态学、毒理学、卫生学为学科基础，广泛吸收和借鉴现代生物技术的一项应用性技术。

水环境生物监测的监测指标包括结构性指标（例如，叶绿素a测定）和功能性指标（例如，光合效率测定）。

从研究方法来看，水环境生物监测包括被动生物监测和主动生物监测，前者是指对环境中某一区域的生物进行直接的调查和分析；后者是指在清洁地区对监测生物进行标准化培育后，再放置到各监测点上，克服了被动监测中的问题，易于规范化，可比性强，监测结果可靠。实际上，这反映了观测科学与实验科学的区别。类似地，人工基质采样、微宇宙试验等都具有主动监测的特性。

（四）生物监测的特点及其在环境监测中的地位

生物监测具有直观性、综合性、累积性、先导性的特点，同时它还具有区域性、定量一半定量的特点，是环境监测的重要组成部分。

生物指标是响应指标，水化学指标是胁迫指标，因此生物监测和理化监测同等重要，不应对立分割，是一个事物的两个方面，是两条都不能缺少的“腿”。

生物监测与化学、物理监测三位一体，相互借鉴，全面反映环境质量、服务环境管理。生物监测要重点着眼于其独有的综合毒性和生物完整性指标。

过去往往认为生物指标是理化指标的补充和佐证，这些都是片面的，需要重新认识和定位。

水环境生物监测在环境质量监测、污染源监测、应急监测、预警监测、专项调查监测等环境监测的各个方面都具有广泛应用的前景。