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3.3 仪器和设备
3.3.1 天平:量程2 kg,感量0.1g;量程2 kg,感量0.01g。
3.3.2 实时荧光PCR仪。
3.3.3 冷冻离心机。
3.3.4 pH计。
3.3.5 移液器:2 uL~10uL、10uL~100uL、100uL~1000uL。
3.3.6 振荡器。
3.3.7 研钵及粉碎装置。
3.4 检测程序
过敏原花生成分实时荧光PCR检测程序见图1。
图1 过敏原花生成分实时荧光PCR检测程序图
3.5 步骤
3.5.1 制样方法
称取约200 g样品,用洁净研钵或合适的粉碎装置将样品粉碎至粉末状。
3.5.2 模板DNA提取
3.5.2.1 CTAB法
称取300 mg已制备好的样品至2 mL离心管中,加入600uL CTAB(若样品吸水性强适当增加CTAB加入量)、40uL 蛋白酶K,振荡均匀,65℃温育30 min;加入500uL酚:三氯甲烷,异戊醇(25:24:1),强烈振荡,12000r/min离心15 min;吸取上层水相至1.5 mL离心管中,加入等体积异丙醇,振荡均匀,12000r/min离心10 min;弃上清液,用预热至65℃ TE缓冲液溶解DNA(TE量视DNA沉淀的多少而定);加入5 uL RNA酶溶液,37℃温育30 min;加入200uL三氯甲烷:异戊醇(24:1),强烈振荡,12000r/min离心15 min;吸取上层水相至新的1.5mL离心管中,加入等体积异丙醇,振荡均匀,12000r/min离心10 min;弃上清液,加入70%乙醇小心清洗沉淀DNA,12000r/min离心1 min;弃上清液,干燥,加预热至65℃ TE缓冲液溶解DNA。每个样品做两个平行样,同时设立试剂提取对照(以水代替样品)。
3.5.2.2 商品化试剂盒方法
商品化基因组提取试剂盒,使用时按照操作说明书进行操作。
3.5.2.3 所提取样品DNA的质量评估
样品中提取的DNA用紫外分光光度法检测,分别计算核酸的纯度及浓度,计算见式(1)、式(2):
DNA纯度=OD260 nm/OD280 nm······(1)
比值在1.7~2.0之间较好,符合PCR检测要求。
双链DNA浓度(ug/mL)=50×OD250nm······(2)
3.5.3 实时荧光PCR扩增
3.5.3.1 反应体系
10×PCR缓冲液5uL、引物对(10 umol/L)各2 uL、探针(10 umol/uL)1.5 uL、dNTP (10mmol/L)1uL、Taq DNA热启动聚合酶(5 U/uL)0.5uL、模板DNA 0.1ug~2ug、补水至50uL。
3.5.3.2 反应参数
预变性95℃10 min, 1个循环;95℃ 15 s, 60℃ 1 min,同时收集FAM荧光,进行45个循环。
3.5.4 质控设置
进行检测时反应体系应设置阳性对照、阴性对照、提取对照。
3.5.4.1 阳性对照
以花生DNA为模板或采用含有扩增片段(花生Ara h2基因序列)的质粒DNA作为模板。
3.5.4.2 阴性对照
采用非花生成分的DNA作为模板。
3.5.4.3 提取对照
采用试剂提取对照作为模板。
4 结果分析及判定
4.1 基线的设置
实时荧光PCR反应结束后进行结果分析时,应设置基线范围。基线范围选择一般在6个~15个循环,如果有强阳性样本,应根据实际情况调整基线范围。阈值设置原则以阈值线刚好超过正常阴性对照扩增曲线(无规则的噪音线)的最高点,且Ct值不出现任何数值为准。
4.2 质控标准
阴性对照:无荧光增幅现象。
提取对照:无荧光增幅现象。
阳性对照:Ct值≤30.0,并且曲线有明显的荧光增幅现象。
以上指标有一项不符合均视为此次实验无效。
若阴性对照或提取对照出现荧光增幅现象,说明在样品提取或反应体系中存在污染,可能出现检测结果假阳性。阳性对照结果无荧光增幅现象,说明反应体系存在问题,检测可能出现假阴性结果。根据对照结果分析问题,重新检测样品。
4.3 结果判定
检测样品无荧光增幅现象,并且阳性对照、阴性对照、提取对照结果正常者,可判定该样品中未检出过敏原花生成分。
检测样品Ct值≤40.0,曲线有明显的荧光增幅现象,并且阳性对照、阴性对照、提取对照结果正常者,可判定该样品中检出过敏原花生成分。
检测样品Ct值在40.0~45.0之间,应重做实时荧光PCR反应。再次扩增后的结果Ct值仍在40.0~45.0之间,并且阳性对照、阴性对照、提取对照结果正常者,可判定样品中检出过敏原花生成分,否则判定该样品中未检出过敏原花生成分。
两个平行样中只要有一个样品检测为阳性,即可判定该样品中检出过敏原花生成分。
相关链接:实时荧光PCR法检测花生成分(一)
文章来源:《食品化妆品检验卷无机元素和放射元素及其他检测方法》
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