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DNA单链断裂检测(彗星实验)

发布时间:2017-03-17 00:00 作者:中国标准物质网 阅读量:2896

单细胞凝胶电泳试验(single cellgel electrophoresis assay, SCGE ),又称彗星试验( cometassay),是一种快速、灵敏、简便、价廉、重复性好的检测环境化学物对单细胞DNA损伤的方法。该方法于1984年首先由Dstling等建立,随后Singh等于1988年改进了实验条件,使之得以更广泛应用于毒理学、肿瘤学、放射生物学及环境和人群监测等方面。
DNA分子在断裂剂的作用下可出现单链或双链断裂,由于DNA形成紧密的超螺旋结构,检测这些断裂需要将双螺旋DNA分子解螺旋,在碱性条件下促使DNA变性和解螺旋,从而有利于单链和双链断裂的DNA在电场中移动,移动的距离与DNA断片分子量和电荷数量相关,经荧光染料染色后,在紫外线照射下发出荧光,使每个受损的细胞均呈现彗星样外观,明亮的头部为细胞核,一系列DNA断片组成彗星尾,尾巴的长度、密度、面积和荧光强度与诱变剂导致的DNA断裂数量成正比,因而通过测定彗尾的长度、面积及荧光强度来评价DNA损伤程度,未受损细胞只有细胞核—彗星核而无彗尾。在一定条件下,DNA迁移距离(彗星尾长)和DNA含量(荧光强度)分布与DNA损伤程度呈线性相关,因此,尾矩(尾部DNA的含量与尾长的乘积)成为定量测定单个细胞DNA损伤程度的主要依据。

【材料】

1.培养的待检细胞(3x105个)。

2.正常熔点琼脂糖(NMA)。

3.低熔点琼脂糖(LMA)。

4. PBS(无钙镁)含0.15 mol/L NaCl, 0.71 mmol/L KH2P04和4.28mmol/L K2HPO4

5.细胞裂解液含2.5mol/L NaCl, 100mmo1/L EDTA,10mmol/L Tris, l% TritonX-100和10% DMSO,pH=10。

6.碱性电泳液10mol/L NaOH 30ml,200mmo1/L EDTA5m1,定容至1000m1, pH = 13 。电泳前新鲜配制。

7.中和缓冲液(0.4mo1/L Tris)Tris48.5g溶于去离子水,定容至1000m1。用HCl调pH至7.5。

8.溴化乙锭(EB)染色液(10x)lmg EB溶于50m1去离子水,临用时10倍稀释。

9.乙醇。

10.全磨砂载玻片、1号盖玻片(24mmx50mm)。

11.电泳仪、电泳槽、荧光显微镜、彗星图像分析软件。

【方法】

1.细胞准备3x105细胞接种于25cm2培养瓶,80%~90%融合时给予不同浓度受试物,达到要求的时间后,消化收集细胞,PBS洗两次,细胞重悬于PBS备用。

2.制胶板层凝胶制备:将全磨砂玻片预热45℃,磨砂面向上置45℃水浴锅或加热板上,将预热40℃完全溶解的100ul无钙镁PBS液制备的1%正常熔点琼脂糖溶液均匀的滴在磨砂玻片上,防止气泡产生,迅速盖上干净的1号盖玻片,置4℃冰箱中10分钟使NMA凝固。

(1)第二层凝胶制备:将20ul含有103~104个受检细胞的PBS细胞悬液和75ul含0.5%无钙镁PBS溶液分别在37℃下预热并混匀,继之取出第一层凝胶片,轻轻揭去盖玻片(注意防止揭坏或使第一层凝胶脱落),迅速将上述混合液滴加在第一层凝胶片上,立即盖上1号盖玻片,置4℃冰箱放置10分钟,使第二层凝固。

(2)第三层凝胶片制备:取出第二层凝胶片,轻轻揭去盖玻片,迅速向上滴加75ul LMA加上盖玻片,4℃ 10分钟凝固。

3.细胞裂解移去胶片上的盖玻片,将载玻片水平浸入(胶片朝上)新配制的预冷的细胞裂解液中,至少裂解1~2小时。

4. DNA碱解旋将载玻片从裂解液中取出,用吸水纸吸干裂解液并列置于水平电泳槽阳极端,电泳槽中加入新鲜配制的碱性电泳缓冲液,将覆盖载玻片胶面0.25cm左右,放置40分钟,以使DNA在碱性条件下解螺旋和产生碱变性区段,使DNA断链在电场中易于迁移。

5.细胞电泳在电压25V,电流强度300mA下,电泳20~40分钟,电压和电流可用改变电泳液液面的高低来调节。

6.漂洗电泳后将载玻片置于平皿内,缓缓沿壁加入0.4mmo1/L Tris-HCI (pH7.5)缓冲液或双蒸水,漂洗2次,每次5~15分钟,弃去Tris-HCI或双蒸水,使用PBS洗干净,并用滤纸吸干水分。再缓缓加入无水乙醇将凝胶浸埋脱水10分钟~1小时之后,吸去乙醇,自然晾干或室温下过夜,晾干。

7.染色每张载玻片加2~3滴染色剂(常用30ul溴化乙锭溶液染色),盖上盖玻片(也可以不盖上),避光染色20分钟。盖上盖玻片的目的是可以隔日分析,或便于操作。

8.阅片及拍照荧光显微镜515~560nm(绿光)波长的激发光,可清楚地观察到核DNA和迁移的DNA(即彗星尾)。每个样本随机选择20~100个细胞,图片保存后,用相应的软件分析结果。

【结果与分析】

1.镜下每张片随机计数100个细胞,计算彗星细胞出现频率,计算在整个观察细胞中有彗尾的细胞占总观察细胞的百分率。也可计算每个细胞拖尾占其体积的百分率对DNA损伤程度进行主观分级评分。见表13-6。

2.采用目镜测微尺,每片计数25~50个细胞,每组2~3张玻片,测量头长与尾长,计算拖尾率。

3.用专业的单细胞凝胶电泳实验分析软件对图像进行分析。测定慧星尾长、尾面积、尾距、尾积分。

【注意事项】

1.制备胶板注意事项

(1)磨砂玻片必须质量好,完全磨砂,防止胶片脱落。

(2)磨砂玻片必须预热40~45℃,使凝胶结合牢固。

(3)加入凝胶时,最后在Tip中的凝胶不用吹下,防止产生气泡。

(4)加盖玻片时防止气泡产生。

(5) 1号盖玻片必须先用乙醇浸泡脱脂,然后在无水乙醇中浸泡,并用滤纸擦干,这样防止盖玻片与凝胶胶着不易揭去,揭盖玻片时必须小心防止揭破胶片,前功尽弃。

(6)胶片操作必须轻拿轻放,防止胶片脱落。

2.裂解时间最少1小时,根据细胞种类可在1~2小时波动,也可过夜,但防止裂解液形成沉淀影响结果。

3.碱解DNA螺旋的pH最好为12,碱解时间不能少于20分钟,过长亦可影响彗尾长度,一般控制在20~40分钟。

4.电泳后的载玻片上的胶板一定用Tris-HCI缓冲液中和至中性,然后方能染色。

5.上述各项操作均应在暗室黄光或红光下操作,以避免额外的DNA损伤。

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