开展微生物监测时，一般选择有代表性的一种或一类微生物作为指示微生物；通过对指示微生物的检测，来了解水体是否受到过的微生物污染。在实际工作中，通常以检验细菌总数、总大肠菌群、粪大肠菌群、大肠埃希氏菌、肠道病毒等作为指示微生物，来间接判断水的卫生学质量。同时，结合高锰酸盐指数、BOD, COD, DO,氨氮及氮磷等理化指标也可以综合反映环境中污染的水平。此外，微生物的生长、繁殖量和其他生理、生化反应也是鉴定微生物生存的环境质量优劣的常用指标。例如发光细菌利用生物发光监测环境污染是一个既灵敏又有特色的方法。

图3.42微生物监测的作用和意义

水环境中的微生物监测方法也是利用了微生物与环境接触的直接性和对其反应的敏感性。当自然水体受空气沉降、土壤、工业废水、生活废水及人畜粪便的影响时，水中有机物不断增加，从而促进了水体中微生物生长及繁殖。我们通过监测水体中特定微生物的数量和种类的变化，即可评价水质状况，反映水质变化趋势，保障水质的卫生安全。

图3.43水中微生物监测的作用和意义