细菌是单细胞的微生物，其细胞中有各种各样复杂的结构，有一般结构和特殊结构。一般结构包括细胞壁、细胞质、内含物、细胞核物质，为所有细胞具有。而芽孢、荚膜和鞭毛等为特殊结构，为某些细菌所特有，也是细胞分类的特征，其功能不同。细菌的细胞结构功能见下表。应当指出并非所有的结构在每一属种的原核细菌中都同时出现。