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(1) 为何要自制上样缓冲液,而不能使用PCR中的10×上样缓冲液?
在凝胶阻滞实验的整个过程中,必须注意不能使蛋白质变性,一旦发生蛋白质变性,则会影响其与探针结合,导致实验失败。因此,从核蛋白提取,标记探针与蛋白质结合,到电泳整个过程中都要防止蛋白变性。PCR中的10×上样缓冲液含有SDS蛋白变性剂,所以不能使用。在自制的上样缓冲液中切忌加入蛋白变性剂。
(2)放射自显影后,为何条带模糊?
不同实验的信号强度不同,如信号较弱,放射自显影时间需要较长,蛋白质一探针复合物区带就会扩散,导致条带模糊。如果电泳结束后,首先干胶,再进行放射自显影,则条带就不会扩散了。
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