(1) 是否任何一个抗体都可以用于ChIP实验？

不同的抗体和抗原结合能力不同，有的抗体可以结合抗原但未必能用在ChIP反应。现在生产抗体的公司对产品的用途都进行标注，随着ChIP的广泛应用，有的厂家对抗体能否用于ChIP也进行了标注，因此在购买及使用前一定仔细阅读抗体的说明书，若厂家没有标注，则需要查找文献或通过预实验来确定抗体的使用。

(2) 剪切过程为何一定要低温及加蛋白酶抑制剂？

ChIP是基于免疫学原理的免疫共沉淀，因此对于可能造成影响抗原决定簇，进而影响与抗体结合的因素应加以控制。为防止蛋白的水解、修饰，溶解抗原的缓冲液必须加蛋白酶抑制剂；利用超声对DNA进行剪切会产生热量，为防止蛋白质热变性，需要在冰上操作。