固相萃取中使用的反相键合硅胶吸附剂多为平均值为40μm的不规则颗粒。与HPLC柱的球形颗粒不同，为了得到最大的表面积，增加与目标化合物的作用范围，SPE吸附剂多采用不规则的多孔键合硅胶。虽然许多生产厂家给出的颗粒粒径指标都是40μm，但这是一个平均值。一般颗粒的粒径在30～60μm的范围。

采用不规则颗粒的另外一个原因是成本因素。根据生产厂家的建议，SPE柱都是一次性使用的。采用球形颗粒作为SPE柱的吸附剂成本过高。键合硅胶吸附剂的平均表面积为500 m2／g，平均孔径为60 A。由于孔径的限制，相对分子质量大于20000的化合物难以进入键合硅胶孔内。如果需要用SPE来分离大分子化合物，可以选用孔径较大的所谓大孔SPE柱。如J．T．Baker公司生产的大孔反相SPE柱，平均孔径为275A。

各厂家生产的反相键合硅胶的含碳量都不一样，但一般都不会超过20％。Martin等对含碳量在5％～22 ％的C18柱进行了测试，发现含碳量在15％左右时的回收率最高。当含碳量在18％～22％时，检测样品的回收率反而下降。这个结果解释了为什么商品化的C18反相硅胶柱的平均含碳量多为11％～17％ 左右。对于残留的硅羟基，有的进行了封尾处理，有的则没有。

因此，在使用商品化的SPE柱前，应该了解清楚吸附剂的性质。需要特别指出的是：由于每个厂家选用的键合硅胶原料不同，生产过程各异，同一类SPE柱的性能可能会有很大的差异。例如，同样是C18柱，由于颗粒大小不同，孔径大小不同，含碳量不同，封尾的程度不同等原因，在相同的操作条件下得到的结果可能会有很大的不同。因此，如果要重复文献上的结果，最好是采用同一厂家生产的SPE柱。否则，可能要对文献提供的方法进行修正。